| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 713887 | 458 (9.400) | 5 (0.120) | 4/86 | NT | 1.2% | coding (479/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | W3110S.gb | = 713894 | 461 (11.010) | coding (486/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
ACCAAGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/713811‑713887‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcatgatGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCACA < W3110S.gb/713894‑713825 ACCAAGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAG < 1:3211795/71‑1ACCAAGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACAAACACCGGCCGTAAATGCAG < 1:3897463/71‑1ACCAAGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGAT‑ACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGa < 1:3303349/71‑2 CCAAGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGC < 1:1124920/71‑1 CAAGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCA > 1:116713/1‑71 AAGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCAT < 1:1495592/71‑1 AGCCGAAACATGTGTCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCAT > 1:211781/1‑70 AGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATG < 1:3475389/71‑1 AGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATG < 1:2129027/71‑1 AGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATG < 1:1936275/71‑1 AGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATG < 1:61352/71‑1 AGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCAT > 1:2605133/1‑70 AGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCAT > 1:2256714/1‑70 AGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCAT > 1:1887205/1‑70 AGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCAT > 1:1276003/1‑70 GCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCATCACCGGCCGTAAATGCAGCATGA < 1:2002346/71‑1 GCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGA > 1:778323/1‑71 GCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGA > 1:4217730/1‑71 GCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGA < 1:1921890/71‑1 GCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGA < 1:1417181/71‑1 GCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGA < 1:3065081/71‑1 GCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGC < 1:644994/67‑1 CCGAAACATGTGGCAGGCAGGCCGTTTTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT < 1:711979/71‑1 CCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT > 1:1691237/1‑71 CCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT < 1:3550024/71‑1 CCGAAACATCTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGA < 1:3064216/70‑1 CGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCAT > 1:773450/1‑67 AAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAG < 1:4040425/62‑1 GTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGC < 1:1200674/57‑1 GCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACAACGGCCGTAAATGCAGC > 1:3733686/1‑55 CCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGATGTGTTCGATCAT < 1:240903/71‑1 CCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT > 1:3434735/1‑50 TATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCAT < 1:4141446/44‑1 TATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCA < 1:256881/43‑1 TTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT > 1:2020288/1‑45 TTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGC < 1:3745611/40‑1 TTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAG < 1:1058989/39‑1 GGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT > 1:2877454/1‑42 ATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT > 1:2058182/1‑38 ATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT > 1:3957164/1‑38 TCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGATGTGTTCGATC < 1:2973988/47‑1 TCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGATGTGTTCGATC < 1:2272271/47‑1 CCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGATGTGTTCGAT > 1:4420485/1‑43 ACACCAACACCGCCCGTAAATGCAGCATGATGTGTTCGATCATGC > 1:2985986/1‑45 GCATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCT > 1:1951580/1‑71 GCATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGT < 1:3250577/67‑1 GCATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGT < 1:4336953/67‑1 GCATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAA < 1:1282795/59‑1 GCATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGT < 1:3098707/43‑1 GCATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGT < 1:1255735/39‑1 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACGCAATACGGCGTGCCTG < 1:36615/71‑1 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTG > 1:2535246/1‑71 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTG > 1:153196/1‑71 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTG > 1:2727362/1‑71 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTG > 1:1132639/1‑71 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTG > 1:834736/1‑71 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCT < 1:3396803/70‑1 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCC < 1:2484166/69‑1 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATA > 1:4234103/1‑60 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATAACCCAATACGGCGTGCCT < 1:555673/70‑1 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGT < 1:1391428/48‑1 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGG > 1:3378935/1‑47 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGT > 1:1989581/1‑42 CATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTT < 1:3412454/39‑1 CATGATGTGTTAGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTG > 1:406689/1‑71 ATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGG > 1:2588499/1‑71 ATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGG > 1:3576417/1‑71 ATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGAT < 1:2874728/50‑1 ATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGT > 1:4386895/1‑43 ATGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGT > 1:1035193/1‑43 ATGATGAGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGT > 1:592154/1‑43 TGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGG > 1:3342599/1‑70 TGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAA < 1:475125/56‑1 TGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTG < 1:4151567/47‑1 TGATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTT < 1:3472965/43‑1 GATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTT < 1:4334940/42‑1 GATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTT < 1:1695736/42‑1 GATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGG < 1:840554/38‑1 GATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTG > 1:4529068/1‑37 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGTCCGGTGTTGGTGTTGG > 1:2307487/1‑43 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCAC < 1:2282029/71‑1 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCA > 1:1836676/1‑70 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCA > 1:1461138/1‑70 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATA > 1:903317/1‑56 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCAC > 1:4235132/1‑50 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATAACCCAATACGGCGTGCCTGGCA > 1:2438971/1‑70 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGA > 1:3312431/1‑46 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGT > 1:2362447/1‑44 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGT > 1:2167400/1‑44 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTG > 1:3846781/1‑42 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTG > 1:2495196/1‑42 ATGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTATTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCAC < 1:2125506/71‑1 TGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCACA > 1:4158927/1‑71 TGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCACA > 1:467675/1‑71 TGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCACA > 1:2738345/1‑71 TGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCA < 1:2706970/69‑1 TGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCAAATACGGCGTGCCT > 1:3952644/1‑65 TGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGA > 1:2246778/1‑45 TGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTG < 1:2882787/44‑1 TGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTG > 1:1824358/1‑38 ACCAAGCCGAAACATGTGCCAGGCACGCCGTATTGGGTGATCACCAACACCAACACCGGCCGTAAATGCAGCATGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/713811‑713887‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcatgatGTGTTCGATCATGCTGCATTTACGGCCGGTGTTGGTGTTGGTGATCACCCAATACGGCGTGCCTGGCACA < W3110S.gb/713894‑713825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |