| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 713380 = | 45 (0.910) | 43 (0.940) | 28/90 | NT | 49.3% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | W3110S.gb | = 4125340 | 47 (1.030) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATA > W3110S.gb/713310‑713448 | gcacacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:4256103‑M1/71‑71 (MQ=255)gAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:2185065/71‑1 (MQ=255) acacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataAtt < 1:736475‑M1/3‑1 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATAGTCCTGGCGACTTGTATTCa > 1:861714/1‑70 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAg > 1:3988714/1‑71 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCa < 1:2106526‑M1/5‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg > 1:3354466‑M1/66‑71 (MQ=255) ttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAg < 1:702791/70‑1 (MQ=255) gtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGc < 1:254341‑M1/7‑1 (MQ=255) taaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt > 1:400516‑M1/64‑71 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg < 1:1268499‑M1/6‑1 (MQ=255) aaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:187127‑M1/8‑1 (MQ=255) cAAGCCAGTCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa < 1:2681709/71‑1 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAg < 1:629503/70‑1 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa < 1:3102347/71‑1 (MQ=255) aggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGac > 1:1637680‑M1/59‑71 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg < 1:685219/71‑1 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg < 1:3700988/71‑1 (MQ=255) aGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgc < 1:2425402/71‑1 (MQ=255) aGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg > 1:3515071/1‑70 (MQ=255) gCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt < 1:3146029/59‑1 (MQ=255) gaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:1214000‑M1/51‑62 (MQ=255) ttGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:861824/1‑71 (MQ=255) aactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca < 1:1438583‑M1/14‑1 (MQ=255) tGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:2297170/1‑70 (MQ=255) actgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:1368465‑M1/22‑1 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:2089403‑M1/48‑57 (MQ=255) cGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:1551856/71‑1 (MQ=255) ctgggtttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa < 1:3497417‑M1/1‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGac > 1:3021769‑M1/45‑57 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:1785341‑M1/26‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:3166698‑M1/26‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:2045042‑M1/26‑1 (MQ=255) tATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:1906187/1‑70 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataAtt > 1:2355639‑M1/42‑44 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt > 1:1323361‑M1/42‑49 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:1611148‑M1/26‑1 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt < 1:3344053‑M1/25‑1 (MQ=255) aTCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGac < 1:352617/54‑1 (MQ=255) ctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt > 1:4300732‑M1/41‑48 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:3241836‑M1/40‑49 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa < 1:1143182‑M1/10‑1 (MQ=255) ttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGAt < 1:1053299‑M1/31‑1 (MQ=255) ttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg < 1:4709110‑M1/32‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa < 1:2302504/71‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa < 1:3843999/71‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGa > 1:3548003/1‑70 (MQ=255) gtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:4700887‑M1/37‑70 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca > 1:1089383/1‑50 (MQ=255) ccGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGCCACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:3791340/1‑70 (MQ=255) gggATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAt > 1:4688414/1‑71 (MQ=255) gATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt > 1:2249857/1‑70 (MQ=255) gATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt > 1:421798/1‑70 (MQ=255) ccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt < 1:1428755‑M1/41‑1 (MQ=255) ccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:2538618‑M1/30‑71 (MQ=255) ccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTACACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:4659641‑M1/30‑71 (MQ=255) caggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa < 1:541483‑M1/12‑1 (MQ=255) aTTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:4569390/1‑70 (MQ=255) tttATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa < 1:4713044/55‑1 (MQ=255) ttATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa < 1:3546474/38‑1 (MQ=255) ggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa > 1:1888387‑M1/27‑61 (MQ=255) gagtcgtttcacccgctaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:2337863‑M1/26‑53 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:4700439‑M1/26‑62 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:4236214/1‑70 (MQ=255) gtcgtttaacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa < 1:408393‑M1/12‑1 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:3072795‑M1/23‑64 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:308889‑M1/23‑69 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:4418904‑M1/50‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:103902‑M1/50‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:3890239‑M1/50‑1 (MQ=255) atatACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:1438401/1‑70 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:2086322‑M1/53‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:4505641‑M1/53‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAt > 1:1698517/1‑57 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAt > 1:4623678/1‑57 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGaa > 1:1705619/1‑61 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:1409589‑M1/17‑70 (MQ=255) aCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:1367393/1‑70 (MQ=255) acccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatga > 1:4641140‑M1/16‑70 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa < 1:388767‑M1/39‑1 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc > 1:602583/1‑71 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc < 1:4163224/71‑1 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga > 1:2525165/1‑62 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:685291/1‑71 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:2587293‑M1/10‑63 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa < 1:293375/70‑1 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:1150986‑M1/9‑51 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat > 1:3647050‑M1/9‑61 (MQ=255) gACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:2041037/1‑41 (MQ=255) gACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAg > 1:1033949/1‑71 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCtaa < 1:1290826‑M1/62‑2 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa < 1:3695394‑M1/43‑1 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg < 1:2870743‑M1/45‑1 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:3675829‑M1/5‑71 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:1429438‑M1/5‑71 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat > 1:2210660‑M1/4‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat > 1:870366/1‑70 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:544905/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:2339256/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:3715362/69‑1 (MQ=255) | GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATA > W3110S.gb/713310‑713448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |