| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3748799 = | 4 (0.150) | 33 (1.210) | 24/98 | NT | 89.2% | coding (184/984 nt) | tnaB | tryptophan transporter of low affinity |
| ? | W3110S.gb | 4056222 = | NA (NA) | intergenic (‑564/+15) | yrhB/insB | hypothetical protein/IS1 transposase InsAB' | |||||
AACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG > W3110S.gb/4056157‑4056284 | aaCGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAAt < 1:1204496/71‑1 (MQ=255)aaCGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAAt > 1:2521571/1‑71 (MQ=255) gAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCaa > 1:1399584/1‑71 (MQ=255) tatatTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACt > 1:1197281/1‑70 (MQ=255) ttttCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGAc > 1:2387989/1‑59 (MQ=255) ttttCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTAtt < 1:2068757/70‑1 (MQ=255) ttttCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTAtt < 1:1740734/70‑1 (MQ=255) ttttCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:2184204/71‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGa > 1:2520061/1‑70 (MQ=255) ttCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 1:574842/70‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 1:1793626/70‑1 (MQ=255) tgCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 1:1372602/65‑1 (MQ=255) ccAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt < 1:389672/70‑1 (MQ=255) atatTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAAt < 1:1294792/44‑1 (MQ=255) tattatCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACt < 1:1739153/53‑1 (MQ=255) ttatCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGAc > 1:474163/1‑44 (MQ=255) ttatCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTa > 1:1749356/1‑53 (MQ=255) tatCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGt < 1:152181/37‑1 (MQ=255) atCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAAt > 1:1375419/1‑39 (MQ=255) atCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTAtt > 1:2100161/1‑53 (MQ=255) tctAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 1:2341116/65‑1 (MQ=255) tAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:2191375/69‑1 (MQ=255) aaTTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGa > 1:1979527/1‑35 (MQ=255) aaTTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa > 1:1153847/1‑70 (MQ=255) aTTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:1612937/1‑58 (MQ=255) aTTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:550499/1‑58 (MQ=255) aTTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:547470/1‑58 (MQ=255) aTTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTGAGATAATg > 1:897365/1‑71 (MQ=255) aTTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa < 1:1668371/68‑1 (MQ=255) tttCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 1:533393/47‑1 (MQ=255) tttCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGa > 1:1412973/1‑47 (MQ=255) ttCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa > 1:400526/1‑67 (MQ=255) tCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:924414/1‑47 (MQ=255) tCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:1940368/64‑1 (MQ=255) tCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCAGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt > 1:1482348/1‑56 (MQ=255) cAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc < 1:1647356/70‑1 (MQ=255) aaaaaaGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTAtt < 1:2056120/41‑1 (MQ=255) aaaaGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt > 1:2407664/1‑70 (MQ=255) aaaGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACtt < 1:1918645/35‑1 (MQ=255) aaGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:1325408/58‑1 (MQ=255) aGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:581459/1‑71 (MQ=255) tACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg > 1:178704/1‑71 (MQ=255) cTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 1:229838/69‑1 (MQ=255) cTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt < 1:427143/70‑1 (MQ=255) cTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt < 1:956177/70‑1 (MQ=255) ttttAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 1:2185375/44‑1 (MQ=255) ttAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:1923655/1‑44 (MQ=40) ttAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa > 1:782038/1‑51 (MQ=38) ttAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa > 1:2135671/1‑69 (MQ=37) ttAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa < 1:209224/69‑1 (MQ=37) ttAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg > 1:2257067/1‑71 (MQ=35) tAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg > 1:2391646/1‑41 (MQ=38) | AACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG > W3110S.gb/4056157‑4056284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |