Missing coverage evidence...
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TTCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGATTT  >  W3110S.gb/350679‑350740                                                              | ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGTCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:387719/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:511614/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:79644/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:703164/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:68950/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:688920/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:687754/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:687645/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:664754/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:64958/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:636902/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:627536/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:565065/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:560098/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:552880/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:145313/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:382722/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:365608/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:33568/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:331108/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:296873/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:296496/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:288764/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:264053/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:224231/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:194395/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:189866/62‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:183694/62‑1 (MQ=255)  tCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:533426/61‑1 (MQ=255)    cAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:150689/59‑1 (MQ=255)     aGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:627490/58‑1 (MQ=255)                gTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGAttt  <  1:500228/47‑1 (MQ=255)                                                              | TTCCAGCTCGACCCCGTCCAGGCGGCATTTAACATCGGCGCGATGATCCGCTGGCTCGATTT  >  W3110S.gb/350679‑350740

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑