Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	643870	652207	8338	35 [0]	[0] 58	[rna]–[citA]	[rna],citT,citG,citX,citF,citE,citD,citC,[citA]

CTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAACA  >  W3110S.gb/643815‑643869                                                       | cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTTATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:94447/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:441890/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:440341/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:466367/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:466628/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:479602/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:505405/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:519849/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:54136/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:623414/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:644918/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:648545/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:653031/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:655868/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:658780/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:677185/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:694669/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:714465/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:280181/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:118226/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:130400/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:189929/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:208226/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:21542/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:235474/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:250791/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:26884/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:111631/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:286400/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:34746/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:359310/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:379774/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:382972/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:399035/1‑55 (MQ=255) cTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAaca  >  1:416428/1‑55 (MQ=255)                                                       | CTTCACTTAGTTTAGCGGCCGTTTCCAGTGATAATCCGGTTTCCGGCGATGAACA  >  W3110S.gb/643815‑643869

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑