Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1965637 1968954 3318 116 [0] [0] 53 [flhA]–[cheY] [flhA],flhB,cheZ,[cheY]

Only 100 of 116 total aligned reads displayed.

CTCCTGGGCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAA  >  W3110S.gb/1965574‑1965636
                                                              |
ctcCTGGGCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGG‑CCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:417109/62‑1 (MQ=255)
     gggCAAGTTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:201320/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTTCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:440006/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGTaa  <  1:321124/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:565594/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:586480/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:544559/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:541489/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:541355/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:540333/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:520458/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:513903/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:508934/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:499008/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:495275/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:481579/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:480877/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:476457/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:470797/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:461963/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:452178/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:424486/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:419374/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:408685/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:40777/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:662010/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:78677/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:73568/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:716970/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:707587/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:706263/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:700636/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:699272/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:697742/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:689217/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:686757/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:686681/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:570070/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:661928/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:660936/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:655544/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:642703/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:636728/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:632066/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:629031/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:624655/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:610832/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:594965/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:118302/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:202171/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:259871/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:255137/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:249273/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:24696/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:239016/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:237977/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:232354/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:221642/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:212124/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:208639/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:2060/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:392758/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:201611/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:191351/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:186891/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:180340/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:177167/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:140977/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:127192/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:123064/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:121665/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:110172/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:262690/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:395187/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:391505/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:389361/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:375758/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:368907/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:365286/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:364536/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:354568/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:352936/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:347072/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:341725/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:332638/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:322401/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:319523/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:30621/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:301933/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:290884/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:279635/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:269339/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:262010/58‑1 (MQ=255)
     gggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCACAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:471527/58‑1 (MQ=255)
      ggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:132119/57‑1 (MQ=255)
      ggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:252586/57‑1 (MQ=255)
      ggCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCAACCTCCTGGaa  <  1:199771/57‑1 (MQ=255)
       gCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:584137/56‑1 (MQ=255)
           aTTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:514879/52‑1 (MQ=255)
           aTTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGaa  <  1:8396/52‑1 (MQ=255)
                                                              |
CTCCTGGGCAAATTTCTTGCGGATACTGCGTATACGGCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAA  >  W3110S.gb/1965574‑1965636

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑