Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3100633	3100641	9	35 [0]	[0] 4	yggL	hypothetical protein

TTCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTGT  >  W3110S.gb/3100571‑3100632                                                              | ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:615667/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:416668/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:419466/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:443242/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:454382/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:507083/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:507901/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:550172/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:589623/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:408275/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:627965/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:636323/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:680068/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:682919/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:702552/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:703829/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:90785/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:271136/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:141881/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:169279/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:202755/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:225916/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:253841/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:257240/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:261070/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:130005/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:274794/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:291531/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:321331/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:32814/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:331995/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:335804/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:359932/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTgt  >  1:369475/1‑62 (MQ=255) ttCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGACAGTTTgt  >  1:634883/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTCCTGCATGCAGATCAGACCTTCCCAGGCCAGATAACCGCTGCCGTCAAAGGCCAGTTTGT  >  W3110S.gb/3100571‑3100632

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑