Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3741942 3744486 2545 106 [0] [0] 46 [yieF]–[yidZ] [yieF],yieE,insD,insC,[yidZ]

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

GCGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGC  >  W3110S.gb/3741880‑3741941
                                                             |
gCGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:104452/62‑1 (MQ=255)
gCGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:80082/62‑1 (MQ=255)
gCGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:258162/62‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCTGAGc  <  1:106712/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCTGAGc  <  1:84238/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGTGc  <  1:452974/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:531700/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:587155/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:532747/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:537646/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:542118/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:547669/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:550830/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:55861/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:574541/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:585557/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:447405/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:527912/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:520872/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:520561/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:520077/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:512632/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:503560/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:496945/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:48298/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:473821/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:448571/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:91126/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:652752/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:102471/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:71885/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:709670/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:691527/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:69122/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:687999/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:683084/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:677132/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:660107/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:655927/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:594282/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:647721/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:642002/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:634178/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:627825/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:62304/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:61763/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:607665/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:603846/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:600029/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:598491/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:16213/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:441276/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:285442/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:283384/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:272018/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:262364/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:235618/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:219888/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:217396/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:216387/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:213279/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:198260/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:298051/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:155735/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:153029/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:147339/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:14697/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:143673/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:13201/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:129127/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:115018/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:112770/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:106039/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:413424/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:434283/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:430704/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:427905/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:427105/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:425866/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:425495/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:422691/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:421738/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:420927/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:415865/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:300693/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:40919/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:36551/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:362264/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:351760/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:338533/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:320466/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:317900/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:312500/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:308989/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTAGCCGGAGc  <  1:592553/61‑1 (MQ=255)
 cGTCATACAAGGGAATGGCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:366173/61‑1 (MQ=255)
                    ggCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:459981/42‑1 (MQ=255)
                      cAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:204355/40‑1 (MQ=255)
                      cAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:128607/40‑1 (MQ=255)
                      cAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGc  <  1:87960/40‑1 (MQ=255)
                                                             |
GCGTCATACAAGGGAATGTCGGCAATGGATGGTAACGCATTGACTTCCATGCTCGCCGGAGC  >  W3110S.gb/3741880‑3741941

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: