Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3838658 3843094 4437 37 [0] [0] 7 [rfaJ]–[rfaL] [rfaJ],rfaY,rfaZ,rfaK,[rfaL]

TTTATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAG  >  W3110S.gb/3838596‑3838657
                                                             |
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTTCAAAGCTTGCagag  <  1:374401/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:618946/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:413766/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:438046/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:456367/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:510659/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:5420/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:557710/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:593994/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:73669/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:635386/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:656918/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:673499/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:67633/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:677391/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:705531/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:166733/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:241784/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:169292/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:19526/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:196487/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:210432/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:21598/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:226061/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:235444/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:344073/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:257495/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:25928/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:266500/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:277501/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:287473/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:325583/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:331044/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:333713/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGAAAAGCTTGCagag  <  1:626566/62‑1 (MQ=255)
tttATATTATTGCTGATGGTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:700286/62‑1 (MQ=255)
                     ataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCagag  <  1:443846/41‑1 (MQ=255)
                                                             |
TTTATATTATTGCTGATGTTTATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAG  >  W3110S.gb/3838596‑3838657

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: