Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4189109	4193175	4067	53 [0]	[0] 165	[rplB]–[rplE]	[rplB],rpsS,rplV,rpsC,rplP,rpmC,rpsQ,rplN,rplX,[rplE]

TAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAG  >  W3110S.gb/4189047‑4189108                                                              | taataaAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:270620/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:5758/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:102720/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:431960/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:432726/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:436612/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:457326/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:476201/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:499407/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:539796/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:549300/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:556875/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:559384/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:430802/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:596759/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:616548/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:635600/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:636932/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:641862/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:643338/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:664815/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:677682/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:701178/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:706975/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:71710/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:254430/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:107658/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:113526/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:114936/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:13175/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:145964/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:150271/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:152923/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:183011/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:195031/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:242329/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:247697/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:426228/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:257893/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:348980/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:388933/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:390885/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:392378/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:405437/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:414177/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:415747/62‑1 (MQ=255) tAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGGCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:32240/62‑1 (MQ=255)  aaTACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:519402/61‑1 (MQ=255)  aaTACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:241706/61‑1 (MQ=255)  aaTACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:170179/61‑1 (MQ=255)  aaTACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:496182/61‑1 (MQ=255)   aTACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:528477/60‑1 (MQ=255)      cAATGGCAGTTGTTATATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAg  <  1:51205/57‑1 (MQ=255)                                                              | TAATACAATGGCAGTTGTTAAATGTAAACCGACATCTCCGGGTCGTCGCCACGTAGTTAAAG  >  W3110S.gb/4189047‑4189108

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑