Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4336757	4340535	3779	70 [0]	[1] 78	basS–[adiC]	basS,basR,eptA,[adiC]

ATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTG  >  W3110S.gb/4336695‑4336756                                                              | aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:575315/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:434961/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:112855/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:45981/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:465617/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:469020/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:469827/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:492611/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:496825/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:503345/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:515186/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:525902/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:538171/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:563197/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:572963/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:574508/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:455429/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:586689/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:593896/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:598952/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:60078/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:604704/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:615384/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:616137/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:649817/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:670982/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:675667/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:697490/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:697876/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:709846/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:78192/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:80658/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:187240/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:333951/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:432430/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:307378/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:276516/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:274329/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:261296/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:211755/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:195052/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:329413/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:18106/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:172692/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:138825/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:136073/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:130842/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:12435/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:119794/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:373016/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:425434/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:424175/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:418837/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:406500/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:392940/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:391207/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:382292/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:334192/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:36494/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:341642/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:341627/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTGAGGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:280454/62‑1 (MQ=255)  tGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:231112/61‑1 (MQ=255)  tGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:496190/61‑1 (MQ=255)   ggCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:517244/60‑1 (MQ=255)   ggCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:528135/60‑1 (MQ=255)                 cTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:231869/46‑1 (MQ=255)                      ttATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:448422/41‑1 (MQ=255)                       tataAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:516329/40‑1 (MQ=255)                        aTCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg  <  1:651116/39‑1 (MQ=255)                                                              | ATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTG  >  W3110S.gb/4336695‑4336756

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑