Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4558623 4577674 19052 85 [0] [0] 119 [uxuB]–[yjiT] [uxuB],uxuR,yjiC,yjiD,yjiE,iadA,yjiG,yjiH,kptA,yjiJ,yjiK,yjiL,yjiM,yjiN,yjiO,yjiP,yjiQ,yjiR,yjiS,[yjiT]

GCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCT  >  W3110S.gb/4558561‑4558622
                                                             |
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACTCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:321988/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:393146/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:464499/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:461714/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:460331/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:458159/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:446543/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:428259/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:422683/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:417815/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:400305/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:474698/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:387848/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:384661/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:382242/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:375266/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:371569/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:107867/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:36601/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:365478/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:639343/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:86625/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:80541/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:7212/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:716756/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:70226/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:697573/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:68390/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:681723/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:671883/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:369403/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:60148/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:594505/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:59132/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:565444/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:547746/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:538670/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:488939/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:481543/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:236857/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:154634/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:154533/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:157669/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:14645/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:145810/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:167998/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:143681/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:186524/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:198844/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:207805/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:21778/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:259156/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:132565/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:357059/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:269667/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:271010/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:271201/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:274171/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:33300/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:302021/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:116214/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:318830/62‑1 (MQ=255)
gCCTCTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:306899/62‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCTGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCTGAAGGTACAGACCt  <  1:35339/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:639704/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:15160/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:13805/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:10827/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:137519/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:576376/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:572569/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:514647/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:169850/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:172034/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:24787/61‑1 (MQ=255)
 ccTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:380572/61‑1 (MQ=255)
  cTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:133011/60‑1 (MQ=255)
  cTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:344920/60‑1 (MQ=255)
            atgatgCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:156156/50‑1 (MQ=255)
              gatgCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:705857/48‑1 (MQ=255)
                  cAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:502412/44‑1 (MQ=255)
                    ggAACACGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:16586/42‑1 (MQ=255)
                    ggAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:130564/42‑1 (MQ=255)
                      aaCAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:410423/40‑1 (MQ=255)
                       aCAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:161708/39‑1 (MQ=255)
                                                             |
GCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCT  >  W3110S.gb/4558561‑4558622

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: