Missing coverage evidence...
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AACCCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCA  >  W3110S.gb/199350‑199411 |                                                              aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCggtgg                          >  1:48129/1‑38 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCggtg                           >  1:461235/1‑37 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGgtcgtcg                    >  1:457714/1‑43 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGgtcg                       >  1:394379/1‑41 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGCCTTcc   >  1:520481/1‑61 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTcc   >  1:421724/1‑61 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTcc   >  1:634333/1‑61 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTcc   >  1:524094/1‑61 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:559597/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:518470/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:526326/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:539777/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:541197/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:434298/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:574413/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:606707/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:611284/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:633615/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:695552/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:699597/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:699978/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:701678/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:70267/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:91901/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:297724/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:140754/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:14734/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:190115/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:195585/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:21528/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:239679/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:273633/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:279312/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:279934/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:330391/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:333536/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:334544/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:365572/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:377527/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:377934/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:415326/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:416896/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCa  >  1:417438/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTACa  >  1:136609/1‑62 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTAAAAt          >  1:482968/1‑54 (MQ=255) aaccCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTATATAATGACTTc    >  1:183884/1‑60 (MQ=255) |                                                              AACCCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCA  >  W3110S.gb/199350‑199411

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑