Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1220789 1220978 190 115 [0] [0] 115 ymgF/ycgH hypothetical protein/ECK1157:JW5901:b1169; hypothetical protein, N‑ter fragment

Only 100 of 115 total aligned reads displayed.

CACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATC  >  W3110S.gb/1220979‑1221040
|                                                             
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:515333/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:559885/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:558565/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:554382/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:55302/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:551766/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:550754/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:544564/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:543826/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:542356/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:536816/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:515391/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:575/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:509875/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:4616/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:45900/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:453389/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:452773/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:429601/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:409172/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:405569/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:391596/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:107938/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:386195/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:657626/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:83752/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:77264/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:715256/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:712726/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:710689/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:699065/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:688992/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:685907/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:679975/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:665228/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:65913/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:386342/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:654780/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:641055/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:635772/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:624765/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:617041/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:607450/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:603374/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:600677/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:600080/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:578182/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:575089/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:171485/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:386170/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:242147/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:241797/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:236803/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:234511/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:232341/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:222321/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:218732/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:213331/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:212741/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:194948/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:182201/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:242983/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:164760/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:163143/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:161842/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:158687/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:153931/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:135994/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:130263/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:120526/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:11552/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:111388/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:11058/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:304720/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:381051/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:365156/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:352861/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:344857/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:342022/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:337467/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:335298/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:322163/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:313501/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:310784/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:30851/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:306445/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:283982/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:281648/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:278023/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:277984/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:268693/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:267914/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:265082/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:264447/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:259504/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:250527/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACCTATTTATc  <  1:57116/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCAGACTTATTTATc  <  1:607930/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAAAGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:44348/62‑1 (MQ=255)
cACCTCAAAGTGAT‑AATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATc  <  1:608726/61‑1 (MQ=255)
|                                                             
CACCTCAAAGTGATCAATGTCATGAAAATAAGGTGAAAAATGATAATGCCGACTTATTTATC  >  W3110S.gb/1220979‑1221040

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑