Missing coverage evidence...
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AAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGT  >  W3110S.gb/1621075‑1621126 |                                                    aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:586241/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:107322/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:376213/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:389401/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:390222/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:427801/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:454984/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:523100/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:523842/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:530919/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:547876/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:548979/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:549263/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:57273/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:580121/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:354304/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:60328/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:608800/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:610489/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:645617/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:655201/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:657751/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:678740/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:688494/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:695446/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:708042/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:71018/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:72332/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:8108/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:261662/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:140188/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:178705/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:182446/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:191285/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:199393/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:214477/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:223218/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:223704/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:240443/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:24067/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:244248/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:253173/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:257478/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:338039/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:28503/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:293736/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:296739/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:301579/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:304342/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:306329/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:318046/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:319949/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:321829/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:326545/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:333922/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:334711/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:335993/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGGGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:600770/52‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGGGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGt  <  1:467196/52‑1 (MQ=255) |                                                    AAGGCTGGGTGGAAAGGTTGCCGAACCCGAATGACAAGCGCGGCGTACTGGT  >  W3110S.gb/1621075‑1621126

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑