Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1671186	1681318	10133	61 [0]	[0] 95	[ynfL]–[ydgI]	[ynfL],ynfM,asr,ydgD,mdtI,mdtJ,ydgG,pntB,pntA,ydgH,[ydgI]

TCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGC  >  W3110S.gb/1681319‑1681362 |                                            tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCaat         >  1:279190/1‑36 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCaa          >  1:566819/1‑36 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:513756/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:551069/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:549470/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:545397/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:54529/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:540500/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:535794/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:52899/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:525729/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:521445/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:518095/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:564226/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:507762/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:502109/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:500980/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:497335/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:490148/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:484989/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:481995/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:480254/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:478754/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:464247/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:456521/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:646769/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:94143/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:92546/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:91610/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:715321/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:707594/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:698164/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:682391/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:673502/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:669731/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:662825/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:656357/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:558288/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:645317/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:633567/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:632408/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:624705/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:623756/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:600848/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:59709/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:596371/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:585713/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:455282/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:209140/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:325506/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:31095/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:304303/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:302298/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:299639/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:298862/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:277464/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:258242/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:245225/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:240232/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:23343/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:325592/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:202045/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:17611/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:15844/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:141771/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:140630/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:134460/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:128667/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:123915/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:116261/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:113716/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:334429/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:431977/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:431767/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:427937/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:424902/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:421982/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:416517/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:412961/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:409312/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:400475/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:390458/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:385112/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:384400/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:384243/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:363392/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:362278/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:356007/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:353453/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:340708/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:334490/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATgg   >  1:169181/1‑43 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATgg   >  1:112110/1‑43 (MQ=255) tCAATGCTGGGCGCCGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:481837/1‑44 (MQ=255) tCAATGCTGGGCCCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc  >  1:442657/1‑44 (MQ=255) |                                            TCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGC  >  W3110S.gb/1681319‑1681362

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑