Missing coverage evidence...
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ACGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGT  >  W3110S.gb/2568252‑2568292 |                                         aCGCCGTGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:674346/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCTCCACGCCCGGt  <  1:17033/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCTCCACGCCCGGt  <  1:604423/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:670375/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:483078/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:544904/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:545671/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:566510/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:58162/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:619949/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:633691/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:640870/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:652439/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:431302/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:687671/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:689583/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:699003/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:83869/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:91162/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:93877/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:98796/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:247580/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:11556/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:143478/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:149936/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:155529/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:168050/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:211194/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:229532/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:240894/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:465254/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:261972/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:291040/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:304780/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:3641/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:397789/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:40169/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:402895/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:42770/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGt  <  1:114171/41‑1 (MQ=255) aCGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCACGGt  <  1:243336/41‑1 (MQ=255) |                                         ACGCCGGGAATTGTTTGCGAAACAGTTCCGCCACGCCCGGT  >  W3110S.gb/2568252‑2568292

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑