| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | W3110S.gb | 2603507 | 2615052 | 11546 | 8 [0] | [0] 154 | [hyfD]–[yfgC] | [hyfD],hyfE,hyfF,hyfG,hyfH,hyfI,hyfJ,hyfR,focB,yfgO,[yfgC] |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
GACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGT > W3110S.gb/2615053‑2615115| gacgaAATTAATGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:123691/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCaa > 1:266940/1‑35 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCaa > 1:368104/1‑35 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCa > 1:467267/1‑47 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCAct > 1:540323/1‑49 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:542502/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:544982/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:533380/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:527516/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:52222/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:519399/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:518076/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:510374/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:4878/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:487724/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:479430/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:476074/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:461426/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:461140/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:453057/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:451861/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:448207/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:445245/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:438589/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:43741/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:428869/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:427795/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:664034/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:98059/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:91355/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:86561/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:73344/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:708753/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:70270/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:697581/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:693695/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:688731/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:675848/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:674709/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:671967/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:405537/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:663045/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:652759/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:646208/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:635817/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:624709/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:613783/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:613244/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:590977/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:586699/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:568968/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:565497/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:183477/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:240705/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:236775/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:235435/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:233855/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:232726/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:229901/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:216675/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:21089/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:202959/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:202839/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:187600/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:245504/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:169134/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:164775/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:161759/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:147701/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:141544/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:138620/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:133998/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:132195/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:125322/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:123613/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:115011/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:326016/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:114989/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:401700/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:399945/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:392470/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:368433/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:367785/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:364106/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:350153/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:346285/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:334457/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:330425/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:407476/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:324293/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:324043/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:317592/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:312896/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:286195/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:263975/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:260510/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:259469/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:251705/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTcc > 1:249726/1‑61 (MQ=255)gacgaAATTAACGCC‑TTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGt > 1:28441/1‑62 (MQ=255)| GACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGT > W3110S.gb/2615053‑2615115 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |