Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3917086 3928166 11081 2 [0] [0] 106 [glyS]–[yhjY] [glyS],insK,insJ,hokA,cspA,yiaG,yiaF,tiaE,yiaD,bisC,yiaC,tag,[yhjY]

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

AGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTTG  >  W3110S.gb/3928167‑3928221
|                                                      
aGCGCCAGATTTTAACGTGACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:482326/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATGACAATAGTtg  <  1:589494/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATGGTtg  <  1:203251/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:46472/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:540160/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:538249/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:521186/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:516091/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:513776/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:510280/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:506684/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:505154/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:494928/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:481020/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:549707/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:458857/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:446373/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:442865/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:426506/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:41923/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:41202/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:391779/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:387563/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:384550/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:371937/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:371199/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:370417/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:679523/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:94595/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:92777/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:87622/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:78200/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:77805/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:715336/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:702931/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:700025/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:697527/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:692204/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:689928/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:542006/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:677880/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:67710/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:675458/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:658503/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:647780/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:640074/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:631976/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:631418/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:614298/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:59270/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:362715/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:175728/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:221709/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:218794/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:211572/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:210278/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:202345/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:200185/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:197226/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:193219/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:184307/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:18230/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:179183/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:177314/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:222760/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:153611/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:148477/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:138887/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:133260/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:130588/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:12918/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:119765/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:10766/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:10755/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:105678/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:104737/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:270500/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:34592/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:331816/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:323951/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:318537/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:317327/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:31523/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:314502/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:30709/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:306014/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:284562/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:273849/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:102340/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:260967/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:260464/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:259045/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:254428/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:24871/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:242234/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:23627/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:235656/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:234995/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:229171/55‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTtg  <  1:223681/55‑1 (MQ=255)
|                                                      
AGCGCCAGATTTTAACGTAACAGTCACAATTGAAACCATTAAATAACAATAGTTG  >  W3110S.gb/3928167‑3928221

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: