Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4540940 4558560 17621 30 [0] [0] 63 yjhS–[uxuB] yjhS,yjhT,yjhA,fimB,fimE,fimA,fimI,fimC,fimD,fimF,fimG,fimH,gntP,uxuA,[uxuB]

GCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCT  >  W3110S.gb/4558561‑4558622
|                                                             
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACTCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:321988/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:538670/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:387848/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:393146/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:400305/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:417815/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:422683/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:428259/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:446543/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:458159/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:460331/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:461714/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:464499/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:474698/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:481543/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:488939/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:382242/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:547746/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:565444/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:59132/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:594505/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:60148/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:639343/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:671883/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:681723/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:68390/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:697573/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:70226/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:716756/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:7212/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:80541/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:86625/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:269667/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:116214/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:132565/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:143681/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:145810/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:14645/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:154533/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:154634/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:157669/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:167998/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:186524/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:198844/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:207805/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:21778/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:236857/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:259156/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:384661/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:271010/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:271201/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:274171/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:302021/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:318830/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:33300/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:357059/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:365478/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:36601/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:369403/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:371569/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:375266/62‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:107867/62‑1 (MQ=255)
gCCTCTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCt  <  1:306899/62‑1 (MQ=255)
|                                                             
GCCTTTGCCCTGATGATGCAGGAACAAGCGCCAACGCTGTCGATGCCGGAAGGTACAGACCT  >  W3110S.gb/4558561‑4558622

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: