Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 121,426 C→T Q42Q (CAG→CAA)  aroP ← aromatic amino acid transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb121,4260CT100.0% 401.6 / NA 195Q42Q (CAG→CAA) aroParomatic amino acid transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/195);  total (0/195)

Only 100 of 195 total aligned reads displayed.

GGACTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAACC  >  W3110S.gb/121423‑121457
   |                               
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ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:576068/35‑1 (MQ=255)
ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:573696/35‑1 (MQ=255)
ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:567702/35‑1 (MQ=255)
ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:552836/35‑1 (MQ=255)
ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:541244/35‑1 (MQ=255)
ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:536294/35‑1 (MQ=255)
ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:534715/35‑1 (MQ=255)
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ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:506352/35‑1 (MQ=255)
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ggATTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAGcc  <  1:144766/35‑1 (MQ=255)
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GGACTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAACC  >  W3110S.gb/121423‑121457

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑