Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 776,123 T→C F183F (TTT→TTC)  tolQ → membrane spanning protein in TolA‑TolQ‑TolR complex

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb776,1230TC100.0% 725.3 / NA 274F183F (TTT→TTC) tolQmembrane spanning protein in TolA‑TolQ‑TolR complex
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/274);  total (0/274)

Only 100 of 274 total aligned reads displayed.

GCGCCCGGTATCGCAGAAGCGTTGATTGCGACTGCAATTGGTCTGTTTGCCGCTATCCCGGCA  >  W3110S.gb/776076‑776138
                                               |               
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   cccGGTATCGCAGAAGCGTTGATTGCGACGGCAATTGGTTTGTTCGCCGCAATTCCGGcg  <  1:292294/60‑2 (MQ=255)
   cccGGTATCGCAGAAGCGTTGATTGCGACGGCAATTGGTTTGTTCGCCGCAATTCCGGcg  <  1:560584/60‑2 (MQ=255)
    ccGGTATCGCAGAAGCGTTGATTGCGACGGCAATTGGTTTGTTCGCCGCAATTCCGGcg  <  1:374673/59‑2 (MQ=37)
                aaGCGTTGATTGCGACGGCAATTGGTTTGTTCGCCGCAATTCCGGcg  <  1:556161/47‑2 (MQ=21)
                    gTTGATTGCGACGGCAATTGGTTTGTTCGCCGCAATTCCGGcg  <  1:44538/43‑2 (MQ=16)
                                               |               
GCGCCCGGTATCGCAGAAGCGTTGATTGCGACTGCAATTGGTCTGTTTGCCGCTATCCCGGCA  >  W3110S.gb/776076‑776138

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑