Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,281,302 C→T E90E (GAG→GAA yejG ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,281,3020CT100.0% 352.5 / NA 172E90E (GAG→GAAyejGhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/172);  total (0/172)

Only 100 of 172 total aligned reads displayed.

TTCAATCGGCATGTTGCAGCAAACTCGTCCTGGCGATTTACAAACA  >  W3110S.gb/2281279‑2281324
                       |                      
ttCAATCGGCATGTTGCTGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:315995/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCTAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:161142/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCTATTTACAAACa  <  1:81176/46‑1 (MQ=38)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:4899/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:569930/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:56833/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:561150/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:561056/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:543802/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:535457/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:529893/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:511924/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:50444/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:502814/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:502272/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:493442/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:581045/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:48476/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:479576/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:473535/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:464639/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:460010/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:45342/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:448666/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:44625/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:436340/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:416420/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:638188/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:93591/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:86572/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:84315/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:716509/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:704456/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:685088/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:682465/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:680796/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:678794/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:672836/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:652112/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:575371/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:629007/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:623754/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:622922/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:61777/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:617004/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:614016/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:602851/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:600886/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:600089/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:592089/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:412554/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:196337/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:257970/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:252641/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:25214/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:243617/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:239461/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:233213/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:224440/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:215293/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:211630/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:206542/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:199128/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:197425/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:268114/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:18431/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:168959/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:168083/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:15342/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:153115/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:14239/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:134517/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:119861/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:119201/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:110974/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:103122/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:278043/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:407960/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:400576/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:398870/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:388931/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:383325/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:373696/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:371074/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:360600/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:354942/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:354296/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:345930/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:342752/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:325704/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:323668/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:32277/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:311959/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:298464/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:296759/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:294411/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:294314/46‑1 (MQ=255)
ttCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:1009/46‑1 (MQ=255)
 tCAATCGGCATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:403518/45‑1 (MQ=255)
         cATGTTGCAGCAAATTCGTCCTGGCGATTTACAAACa  <  1:42810/37‑1 (MQ=255)
                       |                      
TTCAATCGGCATGTTGCAGCAAACTCGTCCTGGCGATTTACAAACA  >  W3110S.gb/2281279‑2281324

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: