Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,977,844 G→A G56G (GGG→GGA)  lysR → DNA‑binding transcriptional dual regulator

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,977,8440GA100.0% 830.5 / NA 403G56G (GGG→GGA) lysRDNA‑binding transcriptional dual regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (403/0);  total (403/0)

Only 100 of 403 total aligned reads displayed.

AAATTGTTTGAGCGCGTACGTGGGCGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGTT  >  W3110S.gb/2977821‑2977879
                       |                                   
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTAc                       >  1:578586/1‑38 (MQ=38)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAg               >  1:343332/1‑46 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:500660/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:572927/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:561424/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:556141/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:551605/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:548146/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:545068/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:533679/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:530863/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:520261/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:511938/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:590306/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:495681/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:484423/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:478046/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:467863/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:458567/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:456124/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:452347/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:448166/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:442759/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:434818/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:428385/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:648560/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:90423/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:85027/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:81937/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:72751/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:709520/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:692597/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:688149/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:683181/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:680215/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:674403/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:662727/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:6558/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:424523/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:645838/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:642233/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:635499/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:632456/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:629348/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:624773/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:617969/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:612998/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:608264/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:603904/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:596167/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:167077/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:268613/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:100093/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:24219/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:236992/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:229074/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:225082/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:215393/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:201447/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:196092/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:183326/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:172671/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:254516/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:163509/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:158779/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:153388/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:150900/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:145906/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:132919/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:128417/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:126298/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:121669/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:109466/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:10398/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:353077/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:417009/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:408978/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:402995/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:394652/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:387713/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:382192/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:377402/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:367348/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:360378/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:356991/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:274603/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:348170/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:338189/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:323472/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:319968/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:311710/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:306418/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:30246/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:29600/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:294064/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtt  >  1:276546/1‑59 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGtc  >  1:288762/1‑58 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGt   >  1:208459/1‑58 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGt   >  1:698113/1‑58 (MQ=255)
aaaTTGTTTGAGCGCATACGTGGACGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGt   >  1:111141/1‑58 (MQ=255)
                       |                                   
AAATTGTTTGAGCGCGTACGTGGGCGATTACATCCTACCGTGCAAGGACTGCGTCTGTT  >  W3110S.gb/2977821‑2977879

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑