Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,343,044 C→T N118N (AAC→AAT)  yrbK → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,343,0440CT100.0% 654.9 / NA 260N118N (AAC→AAT) yrbKconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (260/0);  total (260/0)

Only 100 of 260 total aligned reads displayed.

ATGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAACGCACTTGTGCCAGACTC  >  W3110S.gb/3343004‑3343061
                                        |                 
aTGCCCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:670688/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGGCACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:180314/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACGCGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:17999/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCa                >  1:285148/1‑44 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCCCTCGTGccg       >  1:471718/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:512165/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:584174/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:577083/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:566681/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:563267/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:555882/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:554397/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:548570/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:539384/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:5290/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:525754/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:519253/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:516506/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:589588/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:508627/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:501490/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:480752/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:476312/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:459882/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:451402/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:443083/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:431970/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:428261/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:659866/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:9574/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:92724/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:87318/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:79983/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:713163/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:711575/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:70864/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:692252/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:691965/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:683560/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:669823/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:586540/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:649162/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:64067/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:634558/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:625678/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:614834/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:608194/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:60560/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:603641/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:59284/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:427220/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:195572/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:11030/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:283479/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:273250/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:26026/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:245115/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:238804/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:237834/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:231948/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:230105/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:217338/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:211670/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:289493/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:185269/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:174339/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:168397/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:156202/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:148937/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:146667/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:134485/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:129611/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:125172/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:111356/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:294243/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:426174/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:424562/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:421720/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:419384/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:417867/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:400992/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:397462/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:38853/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:377460/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:365864/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:357616/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:348086/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:337935/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:333841/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:330869/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:324609/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:31939/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:314851/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:307823/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:306043/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:292215/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGcc        >  1:559743/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGCCGGAcag  >  1:74354/1‑56 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGAGccg       >  1:255672/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAACTCAATGCACTCGTGccg       >  1:202451/1‑52 (MQ=255)
                                        |                 
ATGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAACGCACTTGTGCCAGACTC  >  W3110S.gb/3343004‑3343061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑