Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,343,050 T→C L120L (CTT→CTC)  yrbK → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,343,0500TC100.0% 695.0 / NA 257L120L (CTT→CTC) yrbKconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (257/0);  total (257/0)

Only 100 of 257 total aligned reads displayed.

ATGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAACGCACTTGTGCCAGACTC  >  W3110S.gb/3343004‑3343061
                                              |           
aTGACCGTATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:293566/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGGCACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:180314/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCCCTCGTGccg       >  1:471718/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGcct       >  1:306721/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:521393/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:585255/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:583594/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:567881/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:563415/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:558141/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:5545/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:550222/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:539670/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:534090/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:525971/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:586540/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:516749/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:5125/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:509232/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:501490/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:491749/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:476312/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:459882/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:451402/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:431970/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:428537/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:669823/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:9574/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:92724/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:87318/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:79983/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:713163/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:711958/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:70864/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:692252/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:691965/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:683560/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:671666/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:427220/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:665661/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:649162/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:64067/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:636733/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:625678/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:620978/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:608194/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:606876/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:603782/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:59284/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:58985/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:195572/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:11030/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:273250/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:263488/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:254661/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:240989/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:23852/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:23677/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:231948/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:228487/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:217338/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:207570/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:283479/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:181293/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:179844/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:174339/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:168397/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:153210/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:148937/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:142866/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:134485/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:129611/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:125172/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:111356/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:359480/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:426174/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:424729/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:421720/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:420690/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:417867/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:413090/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:397687/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:38853/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:379001/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:365864/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:348888/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:346783/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:336091/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:330869/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:327666/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:322759/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:315949/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:309918/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:29969/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:291385/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGcc        >  1:559743/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGc         >  1:200193/1‑51 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGCCGGAcag  >  1:74354/1‑56 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGATGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:446415/1‑52 (MQ=255)
aTGACCGGATGCTCTATTTAGATGGACACGTTGAAGTCAATGCACTCGTGccg       >  1:285709/1‑52 (MQ=255)
                                              |           
ATGACCGGATGCTCTATTTATATGGACACGTTGAAGTCAACGCACTTGTGCCAGACTC  >  W3110S.gb/3343004‑3343061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑