Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,356,007 C→T G507G (GGC→GGT)  gltB → glutamate synthase, large subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,356,0070CT100.0% 225.0 / NA 115G507G (GGC→GGT) gltBglutamate synthase, large subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/115);  total (0/115)

Only 100 of 115 total aligned reads displayed.

GTTTAACTACAGCGCGGAAGAGCTGGACTCCGTAATTCGCGTACTGGGCGAAAACGGTCAGG  >  W3110S.gb/3355959‑3356020
                                                |             
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atttAACTACAGCGCGGAAGAGCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:55811/61‑1 (MQ=255)
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atttAACTACAGCGCGGAAGAGCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:509690/61‑1 (MQ=255)
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       tACAGCGCGGAAGAGCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:240946/55‑1 (MQ=255)
         cAGCGCGGAAGAGCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:639265/53‑1 (MQ=255)
           gcgcGGAAGAGCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:287556/51‑1 (MQ=255)
            cgcgGAAGAGCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:659232/50‑1 (MQ=255)
            cgcgGAAGAGCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:41292/50‑1 (MQ=255)
               ggAAGAGCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:143905/47‑1 (MQ=25)
                   gagCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:447708/43‑1 (MQ=19)
                    agCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:672497/42‑1 (MQ=19)
                    agCTGGATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:599441/42‑1 (MQ=19)
                        ggATTCGGTGATCCGCGTACTGGGTGAAAACGGTCAgg  <  1:318191/38‑1 (MQ=16)
                                                |             
GTTTAACTACAGCGCGGAAGAGCTGGACTCCGTAATTCGCGTACTGGGCGAAAACGGTCAGG  >  W3110S.gb/3355959‑3356020

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑