Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,634,725 A→C T177T (ACT→ACG)  corA ← magnesium/nickel/cobalt transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,634,7250AC100.0% 831.9 / NA 312T177T (ACT→ACG) corAmagnesium/nickel/cobalt transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (0/312);  total (0/312)

Only 100 of 312 total aligned reads displayed.

ACAGGCGAACTTTCCAGCCGATATCTTCCAGTTCCGCCAGAGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACT  >  W3110S.gb/3634685‑3634747
                                        |                      
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 caGGCGAACTTTCCAGCCGATATCTTCCAGTTCCGCCAGCGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACt  <  1:181035/62‑1 (MQ=255)
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  aGGCGAACTTTCCAGCCGATATCTTCCAGTTCCGCCAGCGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACt  <  1:472195/61‑1 (MQ=255)
  aGGCGAACTTTCCAGCCGATATCTTCCAGTTCCGCCAGCGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACt  <  1:431017/61‑1 (MQ=255)
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      gAACTTTCCAGCCGATATCTTCCAGTTCCGCCAGCGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACt  <  1:75347/57‑1 (MQ=255)
       aaCTTTCCTGCCGATATCTTCCAGTTCCGCCAGCGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACt  <  1:258237/56‑1 (MQ=255)
                     tatCTTCCAGTTCCGCCAGCGTGGAGAGCGCCTCGTAGTTCt  <  1:69964/42‑1 (MQ=37)
                       tCTTCCAGTTCCGCCAGCGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACt  <  1:353560/40‑1 (MQ=255)
                         ttCCAGTTCCGCCAGCGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACt  <  1:115959/38‑1 (MQ=255)
                                        |                      
ACAGGCGAACTTTCCAGCCGATATCTTCCAGTTCCGCCAGAGTGGAGAGCGCCTCGTCGTACT  >  W3110S.gb/3634685‑3634747

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑