Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,010,861 C→G L349L (CTC→CTG)  yhiI → predicted HlyD family secretion protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,010,8610CG100.0% 1017.3 / NA 380L349L (CTC→CTG) yhiIpredicted HlyD family secretion protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base G (380/0);  total (380/0)

Only 100 of 380 total aligned reads displayed.

CCTGACGACCTCGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCT  >  W3110S.gb/4010850‑4010911
           |                                                  
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGc                            >  1:685219/1‑36 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGTAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:356828/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTgg                >  1:437626/1‑48 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTgg                >  1:325076/1‑48 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTTGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:207135/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTTGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:706127/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGt               >  1:345136/1‑49 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTtccc           >  1:415344/1‑53 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGccg  >  1:624789/1‑61 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGcc   >  1:79085/1‑61 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGcc   >  1:556210/1‑61 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGcc   >  1:142076/1‑61 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:529259/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:493634/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:50357/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:508656/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:52035/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:558812/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:540013/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:58223/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:488740/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:487923/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:476356/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:473569/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:460368/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:45653/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:454254/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:445544/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:432727/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:430726/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:640468/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:89867/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:84898/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:713887/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:689467/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:677300/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:672982/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:669732/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:667219/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:663634/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:659772/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:648223/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:566728/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:631544/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:619586/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:617131/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:610391/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:603633/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:599177/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:586678/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:411924/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:574303/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:57197/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:172711/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:424020/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:247468/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:24582/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:237668/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:230049/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:226344/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:198770/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:191164/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:186849/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:182528/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:178325/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:252639/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:163291/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:159490/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:153776/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:133816/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:130631/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:125601/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:118698/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:11700/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:110495/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:106149/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:262723/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:102210/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:409551/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:402504/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:39409/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:386313/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:374759/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:366337/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:361761/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:339514/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:328409/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:318541/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:31342/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:304997/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:298471/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:292391/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:290316/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:287766/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:283984/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:278721/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:270288/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:259827/1‑62 (MQ=255)
ccTGACGACCTGGTAGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:174805/1‑62 (MQ=255)
ccTGAAGACCTGGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCt  >  1:646418/1‑62 (MQ=255)
           |                                                  
CCTGACGACCTCGTGGTGAGGTTGCCGCAATGACGCATCTGGAACTGGTTCCCGTCCCGCCT  >  W3110S.gb/4010850‑4010911

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑