Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3843109 3861606 18498 304 [0] [0] 236 [rfaL]–[lldP] [rfaL],rfaC,rfaF,rfaD,htrL,kbl,tdh,yibD,yibQ,envC,gpmI,yibN,grxC,secB,gpsA,cysE,yibK,lldD,lldR,[lldP]

Only 100 of 304 total aligned reads displayed.

AGAATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGA  >  W3110S.gb/3843047‑3843108
                                                             |
agaATACAAAGTGTATAATCCACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:330009/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:286478/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:309698/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:307935/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:306922/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:305135/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:298048/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:297509/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:296242/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:295503/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:292435/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:289074/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:325424/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:283905/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:280048/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:278856/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:277717/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:273964/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:270912/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:267184/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:100056/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:264378/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:260603/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:258466/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:52901/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:96159/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:91838/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:86150/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:84868/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:82171/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:77414/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:72331/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:69335/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:64630/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:61558/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:56595/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:312376/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:47035/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:41561/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:38970/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:346834/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:346129/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:339611/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:336573/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:33536/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:332247/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:266620/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:141829/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:17166/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:255050/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:166032/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:163983/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:159274/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:157781/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:155476/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:154194/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:151163/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:147911/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:14450/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:169624/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:139094/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:13555/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:133488/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:128821/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:125905/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:12133/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:11578/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:113569/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:109671/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:108424/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:202780/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:252362/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:250380/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:243695/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:240382/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:235316/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:227779/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:226605/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:220744/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:213149/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:208901/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:19972/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:198576/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:195296/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:193553/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:177231/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:191240/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:190231/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:186869/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:184086/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:182602/62‑1 (MQ=255)
agaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTCTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:318265/62‑1 (MQ=255)
 gaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:32458/61‑1 (MQ=255)
 gaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:93207/61‑1 (MQ=255)
 gaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:246761/61‑1 (MQ=255)
 gaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:341310/61‑1 (MQ=255)
 gaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:146411/61‑1 (MQ=255)
 gaATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:37403/61‑1 (MQ=255)
                    cacTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:89525/42‑1 (MQ=255)
                           tttttttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGa  <  1:83084/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
AGAATACAAAGTGTATAATACACTCTCTTTTTTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGA  >  W3110S.gb/3843047‑3843108

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: