Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1022688	1103605	80918	919 [0]	[0] 96	[yccS]–csgD	[yccS],yccF,helD,mgsA,yccT,yccU,yccV,yccW,yccX,yccK,yccA,serT,hyaA,hyaB,hyaC,hyaD,hyaE,hyaF,appC,appB,appA,yccC,etp,yccZ,ymcA,ymcB,ymcC,ymcD,insA,insB,cspH,cspG,ymcE,gnsA,yccM,torS,torT,torR,torC,torA,torD,cbpM,cbpA,yccE,agp,yccJ,wrbA,ymdF,ycdG,ycdH,ycdI,rarA,ycdK,ycdL,ycdM,ycdC,putA,putP,ycdN,ycdN,ycdN,ycdO,ycdB,phoH,ycdP,ycdQ,ycdR,ycdS,ycdT,insF,insE,ymdE,ycdU,serX,ycdW,ycdX,ycdY,ycdZ,csgG,csgF,csgE,csgD

AATCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAACC  >  W3110S.gb/1103606‑1103666 |                                                             aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTatat               >  1:223256/1‑48 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTaa    >  1:293978/1‑59 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:324541/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:332162/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:323940/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:320363/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:320209/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:31665/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:309971/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:308845/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:301617/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:301208/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:301061/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:299303/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:295396/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:291227/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:290820/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:281618/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:277891/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:274187/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:266991/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:264928/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:257047/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:63677/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:98498/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:92392/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:91951/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:91759/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:91215/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:88182/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:82717/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:80103/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:71898/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:68447/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:261027/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:38144/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:38035/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:35321/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:348294/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:345862/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:345583/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:345490/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:34138/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:338068/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:332623/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:140402/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:178951/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:175024/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:245536/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:167838/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:160773/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:151932/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:151165/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:14832/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:142126/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:168804/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:12538/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:123076/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:122518/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:12056/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:117784/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:116637/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:105610/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:104271/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:237942/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:227413/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:226770/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:228384/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:232741/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:224848/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:224257/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:235388/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:221151/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:207903/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:239329/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:205960/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:200372/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:187811/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:143927/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:117002/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:102089/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:13440/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:240147/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:247776/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:37919/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:310650/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:147466/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:151332/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:340510/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:161047/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:19073/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:179281/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:181340/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAc   >  1:315031/1‑60 (MQ=255) aaTCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAAAGTAACTCGATATATTAAAATGTTAAcc  >  1:94472/1‑61 (MQ=255) aaTCTTAAAACAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAAcc  >  1:118623/1‑61 (MQ=255) |                                                             AATCTTAAATCAAGTGTTAAACATGTAACTAAATGTAACTCGTTATATTAAAATGTTAACC  >  W3110S.gb/1103606‑1103666

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑