Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,164,560 C→T L116L (CTG→TTG)  ycfM → predicted outer membrane lipoprotein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,164,5600CT100.0% 479.3 / NA 255L116L (CTG→TTG) ycfMpredicted outer membrane lipoprotein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (255/0);  total (255/0)

Only 100 of 255 total aligned reads displayed.

AGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAA  >  W3110S.gb/1164533‑1164593
                           |                                 
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGTCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:232882/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGaa                     >  1:100559/1‑42 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGaa                     >  1:326470/1‑42 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAg                    >  1:179889/1‑43 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGAcc               >  1:235703/1‑48 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGaa            >  1:95868/1‑51 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAAc          >  1:267655/1‑53 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGat  >  1:113884/1‑60 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:295309/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:28110/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:302903/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:305800/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:309036/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:31148/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:317854/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:322290/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:331814/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:2945/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:284432/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:283150/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:339062/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:277174/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:274624/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:273124/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:263199/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:261629/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:258212/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:62883/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:98318/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:97479/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:88735/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:88161/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:86428/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:84668/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:83982/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:81760/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:77423/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:71676/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:70430/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:67442/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:333200/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:53215/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:5065/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:49173/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:44237/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:40120/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:38056/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:347964/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:343625/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:343181/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:342004/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:253720/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:145546/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:256837/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:170149/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:16900/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:168484/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:167084/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:163518/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:159222/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:155408/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:15334/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:14979/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:149113/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:173196/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:14391/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:135917/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:131231/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:127592/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:126685/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:122542/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:121400/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:118555/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:110731/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:108735/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:106307/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:178081/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:246192/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:243863/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:242572/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:239246/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:238483/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:231146/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:224898/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:223010/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:214698/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:212103/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:205891/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:20093/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:200084/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:199238/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:196852/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:191849/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:189857/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:186334/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:183691/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGaa  >  1:176680/1‑61 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGa   >  1:286607/1‑60 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGa   >  1:128175/1‑60 (MQ=255)
aGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGTTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGa   >  1:274475/1‑60 (MQ=255)
                           |                                 
AGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAA  >  W3110S.gb/1164533‑1164593

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑