Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,861,630 A→G S463S (TCT→TCC)  lldP ← L‑lactate permease

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,861,6300AG100.0% 504.1 / NA 240S463S (TCT→TCC) lldPL‑lactate permease
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/240);  total (0/240)

Only 100 of 240 total aligned reads displayed.

GCTTGCAGCGCGGCGAACAGGGCGTTAGATGAGGTATCCGACCCGGTCAGGAATACCCCCAG  >  W3110S.gb/3861604‑3861665
                          |                                   
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  ctGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:222817/59‑1 (MQ=255)
  ctGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:323674/59‑1 (MQ=255)
  ctGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:69090/59‑1 (MQ=255)
   tGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:100020/59‑1 (MQ=255)
             agAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:191803/48‑1 (MQ=255)
                          |                                   
GCTTGCAGCGCGGCGAACAGGGCGTTAGATGAGGTATCCGACCCGGTCAGGAATACCCCCAG  >  W3110S.gb/3861604‑3861665

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑