Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 1533079 | 1545823 | 12745 | 61 [0] | [0] 250 | yncM–narU | yncM,ydcC,ydcE,yddH,nhoA,yddE,narV,narW,narY,narZ,narU |
GTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGC > W3110S.gb/1533017‑1533078 | gTCAGTAACGTAACGCCTGAAGTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:287898/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:793392/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:1001582/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:618680/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:667901/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:682691/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:683906/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:693004/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:699261/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:720198/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:72815/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:760974/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:76364/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:777449/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:783588/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:7880/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:581235/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:794876/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:803781/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:837293/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:85326/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:887499/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:923356/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:924388/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:938465/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:94853/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:949110/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:964636/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:987034/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:369941/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:110431/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:11765/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:162276/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:17304/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:177983/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:281823/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:316969/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:329641/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:357153/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:35813/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:367655/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:577309/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:376281/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:402560/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:552116/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:543521/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:528524/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:521559/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:515327/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:447281/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:427481/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:423693/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:414282/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:39907/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGAGTAAAAAAGc < 1:541711/62‑1 (MQ=255) gTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGCGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:182332/62‑1 (MQ=255) ctCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:891979/61‑1 (MQ=255) tCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:894634/61‑1 (MQ=255) tCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:731369/61‑1 (MQ=255) gtaacgCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:208390/53‑1 (MQ=255) aaCTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGc < 1:636209/43‑1 (MQ=255) | GTCAGTAACGTAACGCCTGAACTTTTGTGATTTTGAATTCGAATGGAAGGGATTAAAAAAGC > W3110S.gb/1533017‑1533078 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |