Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 1851605 | 1858114 | 6510 | 150 [0] | [0] 48 | [sppA]–[ydjH] | [sppA],ansA,pncA,ydjE,ydjF,ydjG,[ydjH] |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCA > W3110S.gb/1851543‑1851604 | cTTTGCTAATGGCGCTATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:946074/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGTATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:316109/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCATGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:243090/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:61696/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:725628/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:686559/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:672046/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:669164/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:66406/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:657852/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:654416/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:646135/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:635435/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:768282/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:604882/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:604566/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:580046/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:564989/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:555873/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:542625/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:526435/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:1001066/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:505077/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:487430/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:882060/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:988014/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:978554/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:973169/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:95644/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:936991/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:92810/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:920636/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:907509/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:893029/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:88826/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:767141/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:880016/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:871503/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:863618/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:853191/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:850858/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:815784/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:808517/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:797137/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:79010/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:515990/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:150628/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:285584/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:486150/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:248589/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:23585/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:223531/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:189375/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:181106/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:169416/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:165203/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:161490/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:280209/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:145275/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:134578/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:130967/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:120547/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:119132/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:1039334/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:1034510/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:1020137/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:1007333/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:422182/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:484329/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:482072/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:47668/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:449800/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:438345/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:434697/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:310831/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:417820/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:399545/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:397373/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:395653/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:342414/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGGGATACCa < 1:59172/62‑1 (MQ=255) cTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGCCGGTGATACCa < 1:306258/62‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:204441/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:984147/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:496845/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:1024984/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:479826/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:115382/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:339767/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:531044/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:121399/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:687314/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:882453/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:717542/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:275876/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:404178/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:835124/61‑1 (MQ=255) tttGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:622469/61‑1 (MQ=255) aTTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCa < 1:677497/46‑1 (MQ=255) ttATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGTATGTTGGCGGTGATACCa < 1:440338/45‑1 (MQ=255) | CTTTGCTAATGGCGCAATTATGGATGGCGAGGAAACTCAGGGGAATGTTGGCGGTGATACCA > W3110S.gb/1851543‑1851604 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |