Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1958968	1965528	6561	29 [0]	[0] 2	[torY]–[flhA]	[torY],cutC,yecM,argS,yecT,flhE,[flhA]

GCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGC  >  W3110S.gb/1958906‑1958967                                                              | gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:497617/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:980598/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:968013/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:964539/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:889654/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:853669/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:732863/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:719829/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:603836/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:593096/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:590248/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:58278/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:554386/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:55230/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:548661/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:113302/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:493369/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:492325/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:479799/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:392167/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:388862/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:37974/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:36991/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:368064/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:316260/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:308255/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:216489/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:171410/1‑62 (MQ=255) gcgcAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGc  >  1:141791/1‑62 (MQ=255)                                                              | GCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGTATTGCCATAGCGGTTTACGGTCCGCTAATGC  >  W3110S.gb/1958906‑1958967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑