Missing coverage evidence...
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CGGCGGAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAT  >  W3110S.gb/2210197‑2210258                                                              | cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCGGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:924261/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:732546/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:525608/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:530355/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:532847/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:549040/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:550078/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:639362/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:65215/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:669360/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:716705/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:497338/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:754467/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:776769/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:800025/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:807575/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:885107/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:924024/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:93845/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:26344/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:14956/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:164246/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:165378/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:180218/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:18357/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:190008/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:195583/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:202895/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:223505/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:1029367/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:305091/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:308598/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:327730/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:388210/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:405466/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:442644/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:483547/1‑62 (MQ=255) cggcggAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAt  >  1:490046/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGGCGGAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACAT  >  W3110S.gb/2210197‑2210258

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑