Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3083645 3088495 4851 168 [0] [0] 213 [speA]–[sprT] [speA],yqgB,yqgC,yqgD,metK,galP,[sprT]

Only 100 of 168 total aligned reads displayed.

TCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACG  >  W3110S.gb/3083583‑3083644
                                                             |
tCACCGAACAGTCGGACTTCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:805669/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:558949/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:708509/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:691169/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:688473/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:675244/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:671381/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:649330/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:641532/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:60770/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:582733/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:560438/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:73574/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:558508/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:507408/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:492976/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:4829/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:475540/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:1000059/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:452975/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:447166/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:442827/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:441780/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:904677/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:985708/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:970652/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:967912/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:962653/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:953226/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:945112/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:941027/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:923918/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:91508/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:908869/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:715659/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:893615/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:87509/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:838782/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:833129/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:820836/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:809297/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:788450/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:752497/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:738102/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:46893/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:177333/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:332047/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:327707/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:436818/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:300303/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:292767/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:291868/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:281225/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:271346/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:262647/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:253773/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:204779/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:191342/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:305958/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:15694/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:156669/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:145819/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:143556/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:13008/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:121458/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:118605/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:108346/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:1025549/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:1012179/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:1005110/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:336009/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:435236/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:428137/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:419998/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:416806/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:415365/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:404516/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:397567/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:391568/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:388802/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:387292/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:349754/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:34385/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:379649/62‑1 (MQ=255)
tCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:385164/62‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAAGGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:729010/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCTCGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:531672/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:600510/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:113612/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:367073/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:143309/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:89610/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:773002/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:530501/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:538225/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:775929/61‑1 (MQ=255)
 cACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:676564/61‑1 (MQ=255)
       aCAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:491410/55‑1 (MQ=255)
       aCAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:407225/55‑1 (MQ=255)
          gTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACg  <  1:379975/52‑1 (MQ=255)
                                                             |
TCACCGAACAGTCGGACTGCGAACGAGTACCTTCATAATCCACGCCCAGACCGCCGCCGACG  >  W3110S.gb/3083583‑3083644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: