Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3377220 3397800 20581 326 [0] [1] 303 [sspA]–[yhdE] [sspA],rpsI,rplM,yhcM,yhcB,degQ,degS,mdh,argR,yhcN,yhcO,aaeB,aaeA,aaeX,aaeR,tldD,yhdP,rng,[yhdE]

Only 100 of 326 total aligned reads displayed.

GTTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATG  >  W3110S.gb/3377158‑3377219
                                                             |
gtTCTATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:851647/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATTTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCAAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:864869/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTTCACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:435632/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGAGCTGATGGCTATAGATg  <  1:884064/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:781192/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:79907/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:769189/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:757513/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:743165/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:730623/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:718404/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:712074/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:70453/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:69611/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:687766/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:684340/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:671480/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:656213/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:637418/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:615893/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:596757/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:580301/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:577490/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:5677/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:554062/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:542128/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:52739/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:897963/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:985120/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:972701/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:96630/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:961236/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:948178/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:944789/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:937917/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:925564/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:923147/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:913015/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:907848/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:783710/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:881083/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:874781/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:859178/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:840766/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:833044/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:826914/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:818796/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:812187/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:803933/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:525218/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:181528/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1000933/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:299343/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:290861/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:285185/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:273612/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:268023/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:2584/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:252319/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:250329/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:240363/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:231363/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:212251/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:30221/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:174701/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:160195/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:143115/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:136727/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:123339/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:113794/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:111624/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1035961/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1024873/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1017006/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1007275/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:414572/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:513805/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:506683/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:500961/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:493105/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:490498/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:481399/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:4771/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:46528/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:460782/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:449341/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:419420/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:310670/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:408510/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:390381/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:378695/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:369207/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:365918/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:358234/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:350010/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:332911/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:322440/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:316947/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCACGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:153619/62‑1 (MQ=255)
 ttCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:736921/61‑1 (MQ=255)
                                                             |
GTTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATG  >  W3110S.gb/3377158‑3377219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: