Missing coverage evidence...
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CGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATCGCC  >  W3110S.gb/3964315‑3964375                                                             | cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCCGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:927219/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCCGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:332795/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTACCGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:1015567/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:551292/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:994519/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:561531/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:570085/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:572164/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:576346/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:582437/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:595136/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:607884/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:658131/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:677653/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:705171/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:72823/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:780135/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:796729/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:805617/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:922320/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:932921/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:968492/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:978301/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:1011359/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:276436/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:1035725/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:1043076/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:13155/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:165255/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:168208/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:179106/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:183725/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:210767/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:257282/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:510239/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:304262/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:336845/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:348819/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:353855/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:367819/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:387353/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:403292/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:429120/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:432588/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:484576/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:501767/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTCGCGTCTCATGGGACAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:969917/1‑61 (MQ=255) cGACTGATGTAGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATcgcc  >  1:733639/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGACTGATGTCGCGTCTCATGGGTCAGCAGCAGGGCGATTAACGTCAAGCCAGCCATCGCC  >  W3110S.gb/3964315‑3964375

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑