Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 420470 | 427969 | 7500 | 2 [0] | [0] 162 | [proY]–[secD] | [proY],malZ,yajB,queA,tgt,yajC,[secD] |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
CCCTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTG > W3110S.gb/427970‑428031 | cccTGTTTGTGTAGTACAAAGACAGCGGTAAGAATGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:454620/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTTCAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:27547/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTGCAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:230902/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCTAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:662878/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCGAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:975204/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:634225/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:737644/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:720503/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:714572/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:693920/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:685761/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:684931/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:653855/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:64873/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:643178/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:640564/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:788906/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:622202/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:614849/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:608479/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:59033/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:589117/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:578555/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:571873/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:538755/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:535810/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:520443/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:860063/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:991704/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:985938/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:968348/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:949154/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:94013/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:933040/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:909049/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:9074/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:88642/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:876082/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:86631/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:776377/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:859807/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:854123/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:852257/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:831206/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:828563/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:824136/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:814364/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:796633/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:796574/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:511558/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:788437/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:209652/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:338441/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:332211/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:328915/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:3263/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:314230/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:313377/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:303424/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:271335/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:254080/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:240323/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:233605/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:228917/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:342747/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:191683/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:189300/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:14980/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:133876/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:130570/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:12668/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:104591/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:1036271/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:1028621/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:1025338/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:1009438/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:430639/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:1008891/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:504298/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:491387/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:487240/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:471114/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:465019/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:463636/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:45932/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:446844/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:437597/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:43639/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:514516/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:415500/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:414426/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:404280/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:400568/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:398163/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:394820/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:39229/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:386202/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:373659/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTg < 1:35995/62‑1 (MQ=255) cccTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGACGTGCGGTTCTGGTg < 1:740570/62‑1 (MQ=255) | CCCTGTTTGTGGAGTACAAAGACAGCGGTAAGAAAGATGCAAATGGTCGTGCGGTTCTGGTG > W3110S.gb/427970‑428031 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |