Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 2319129 | 2324549 | 5421 | 189 [0] | [0] 310 | [rcsD]–rcsC | [rcsD],rcsB,rcsC,insD,insC,rcsC |
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
GGCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAC > W3110S.gb/2324550‑2324611 | ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTTAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:801148/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAg > 1:499019/1‑54 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTa > 1:338371/1‑61 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTa > 1:944158/1‑61 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTa > 1:657486/1‑61 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTa > 1:819301/1‑61 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTa > 1:475210/1‑61 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:695371/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:773909/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:767559/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:759976/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:751393/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:729141/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:725847/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:71803/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:703667/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:699984/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:696359/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:787535/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:688799/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:680650/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:669065/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:646639/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:644394/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:637678/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:632891/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:624980/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:60779/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:860971/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:98671/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:982484/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:974997/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:961635/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:938751/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:92658/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:915196/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:909674/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:900233/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:878212/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:872611/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:780972/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:856106/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:847045/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:838122/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:835029/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:831440/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:811954/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:796078/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:793402/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:790251/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:586209/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:21219/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:306655/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:304775/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:298304/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:278669/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:270098/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:262153/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:25076/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:245373/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:235266/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:222564/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:215618/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:314808/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:197668/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:18907/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:17850/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:173837/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:151207/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:138556/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:12592/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:1029616/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:1026383/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:1013943/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:100368/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:436271/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:1000127/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:572467/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:565105/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:554554/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:541533/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:529382/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:522242/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:505543/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:494048/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:482272/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:468607/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:453956/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:592996/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:426425/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:395576/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:385361/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:375390/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:356499/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:347443/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:339171/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:328055/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAc > 1:321409/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGAGTTAc > 1:410031/1‑62 (MQ=255) ggCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAACGTGTTAc > 1:825551/1‑62 (MQ=255) | GGCGAAGCTCCGCCTCAGGTGACCGATGGAGTGTGGTTAAGGTAGCGGTAAAAGCGTGTTAC > W3110S.gb/2324550‑2324611 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |