Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 3371751 | 3377157 | 5407 | 46 [0] | [0] 307 | [nanT]–[sspA] | [nanT],nanA,nanR,dcuD,sspB,[sspA] |
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
GTTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATG > W3110S.gb/3377158‑3377219 | gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:675125/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:781763/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:776595/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:757513/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:743165/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:738846/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:730623/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:718404/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:712074/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:705123/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:697693/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:689806/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:684545/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:797130/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:669417/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:649063/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:615948/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:599635/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:584616/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:579504/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:570626/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:55694/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:551886/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:536174/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:1000933/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:882975/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:985120/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:972701/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:96630/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:962288/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:948178/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:944789/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:937917/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:923495/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:918257/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:909001/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:899966/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:889374/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:527357/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:874781/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:866725/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:861455/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:856038/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:8442/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:839114/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:828598/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:818796/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:812187/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:80721/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:799590/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:179173/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:522813/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:296345/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:290861/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:285185/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:273612/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:268023/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:2584/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:252319/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:250329/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:240363/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:231363/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:20903/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:301892/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:163626/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:159349/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:151738/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:136727/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:126298/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:117954/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:11275/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:1037040/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:1028165/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:1023391/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:1015608/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:419194/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:513805/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:506683/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:500961/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:493105/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:490498/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:480651/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:466265/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:464724/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:450610/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:43716/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:422340/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:310670/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:412991/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:401668/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:386705/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:378695/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:369207/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:365918/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:358234/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:350825/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:332911/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:322440/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg < 1:312697/62‑1 (MQ=255) gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATCGCTATAGATg < 1:932529/62‑1 (MQ=255) | GTTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATG > W3110S.gb/3377158‑3377219 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |