Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3371751 3377157 5407 46 [0] [0] 307 [nanT]–[sspA] [nanT],nanA,nanR,dcuD,sspB,[sspA]

Only 100 of 307 total aligned reads displayed.

GTTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATG  >  W3110S.gb/3377158‑3377219
|                                                             
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:675125/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:781763/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:776595/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:757513/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:743165/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:738846/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:730623/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:718404/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:712074/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:705123/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:697693/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:689806/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:684545/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:797130/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:669417/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:649063/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:615948/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:599635/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:584616/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:579504/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:570626/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:55694/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:551886/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:536174/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1000933/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:882975/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:985120/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:972701/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:96630/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:962288/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:948178/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:944789/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:937917/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:923495/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:918257/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:909001/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:899966/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:889374/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:527357/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:874781/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:866725/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:861455/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:856038/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:8442/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:839114/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:828598/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:818796/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:812187/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:80721/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:799590/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:179173/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:522813/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:296345/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:290861/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:285185/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:273612/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:268023/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:2584/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:252319/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:250329/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:240363/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:231363/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:20903/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:301892/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:163626/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:159349/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:151738/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:136727/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:126298/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:117954/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:11275/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1037040/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1028165/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1023391/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:1015608/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:419194/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:513805/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:506683/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:500961/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:493105/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:490498/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:480651/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:466265/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:464724/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:450610/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:43716/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:422340/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:310670/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:412991/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:401668/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:386705/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:378695/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:369207/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:365918/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:358234/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:350825/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:332911/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:322440/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATg  <  1:312697/62‑1 (MQ=255)
gtTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATCGCTATAGATg  <  1:932529/62‑1 (MQ=255)
|                                                             
GTTCGATCTCGAAACTTACACCTTTCTCAGCCAGCACAATGCGGACCTGATGGCTATAGATG  >  W3110S.gb/3377158‑3377219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: