Missing coverage evidence...
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GCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAC  >  W3110S.gb/4630938‑4630999 |                                                              gCTGTGCAAACTGTCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:2466/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGTTGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:863365/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:691709/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:517932/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:51885/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:530981/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:545274/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:551880/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:594055/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:653947/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:676819/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:509147/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:726112/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:820258/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:83948/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:85348/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:983256/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:132049/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:506902/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:435503/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:396709/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:385235/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:370344/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:359141/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:344622/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:2784/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:249543/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:242685/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:183606/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:161146/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:146791/62‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAc  <  1:137538/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAAC  >  W3110S.gb/4630938‑4630999

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑