Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 33,903 T→C I1029I (ATT→ATC)  carB → carbamoyl‑phosphate synthase large subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb33,9030TC99.6% 562.7 / ‑6.3 243I1029I (ATT→ATC) carBcarbamoyl‑phosphate synthase large subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  major base C (0/242);  minor base A (0/1);  total (0/243)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01

Only 100 of 243 total aligned reads displayed.

TTGAAGACTCCCGCGTGATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACC  >  W3110S.gb/33884‑33945
                   |                                          
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:68818/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:753928/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:749835/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:738937/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:732016/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:729776/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:721674/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:713073/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:707504/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:704923/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:70135/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:694601/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:761324/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:677722/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:655592/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:649548/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:615647/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:586046/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:573938/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:553173/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:532236/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:519305/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:1003856/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:495236/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:872050/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:969784/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:965549/62‑1 (MQ=255)
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ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:924099/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:918143/62‑1 (MQ=255)
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ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:896452/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:89359/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:889515/62‑1 (MQ=255)
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ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:857397/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:844920/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:834336/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:824820/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:821687/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:808980/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:798725/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:77842/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:776165/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:768778/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:168056/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:309341/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:277572/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:273652/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:271257/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:235606/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:230869/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:225971/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:222780/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:212543/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:204873/62‑1 (MQ=255)
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ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:303407/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:156587/62‑1 (MQ=255)
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ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:139253/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:132447/62‑1 (MQ=255)
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ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:115978/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:110169/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:1025289/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:1013524/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:1005302/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:1005041/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:332478/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:475250/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:473879/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:454901/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:44644/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:440639/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:432155/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:430351/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:424771/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:419032/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:409393/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:397109/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:352005/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:321367/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:336708/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:343129/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:359837/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:369254/62‑1 (MQ=255)
ttGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:376115/62‑1 (MQ=255)
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 tGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:385527/61‑1 (MQ=255)
 tGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:545653/61‑1 (MQ=255)
 tGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:840365/61‑1 (MQ=255)
 tGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:288860/61‑1 (MQ=255)
 tGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:515875/61‑1 (MQ=255)
 tGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:487377/61‑1 (MQ=255)
 tGAAGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:504978/61‑1 (MQ=255)
   aaGACTCCCGCGTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:669374/59‑1 (MQ=255)
             cgTGATCCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACaccacc  <  1:189017/49‑1 (MQ=255)
                   |                                          
TTGAAGACTCCCGCGTGATTCGTCGCAGTGCGCTGCAATATAAAGTGCATTACGACACCACC  >  W3110S.gb/33884‑33945

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑