Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,088,548 C→T S46S (TCC→TCT)  sprT → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,088,5480CT100.0% 503.0 / NA 205S46S (TCC→TCT) sprTconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (205/0);  total (205/0)

Only 100 of 206 total aligned reads displayed.

TAGGGCGTAACTACCCGGAGCCAAAACTCTCTTACACCCAGCGCGGAACCTCCGCCGGAACG  >  W3110S.gb/3088496‑3088557
                                                    |         
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tAGGGCGTAACTAACCGGAGCCAAAACTCTCTTACACCCAGCGCGGAACCTCTGCCGGAAca  >  1:1042871/1‑61 (MQ=255)
                                                    |         
TAGGGCGTAACTACCCGGAGCCAAAACTCTCTTACACCCAGCGCGGAACCTCCGCCGGAACG  >  W3110S.gb/3088496‑3088557

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑