BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,861,552	A→G	N489N (AAT→AAC)	lldP ←	L‑lactate permease

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,861,552	0	A	G	99.9%	1597.4 / NA	684	N489N (AAT→AAC)	lldP	L‑lactate permease
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (683/0); minor base T (1/0); total (684/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 684 total aligned reads displayed.

GGTGACGCCACCGGTGGTATTGGCGGCAACCAGCAACAGATCAGAGACGCCAATTTGTTGTGC > W3110S.gb/3861534‑3861596

ggTGACACCCCCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg > 1:798559/1‑62 (MQ=255)

ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGcagcaaccagcaac                            >  1:888528/1‑37 (MQ=25)

ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGcagcaaccagcaac                            >  1:704354/1‑37 (MQ=25)

ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGGAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg > 1:717035/1‑62 (MQ=255)

ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCCGCAACCAGCAACa                           >  1:287539/1‑38 (MQ=25)

ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCACCCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:100167/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCATCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:388654/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGCAACGcc              >  1:915695/1‑51 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAATGCCAATTTGTtgtg   >  1:857342/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTtgttgt    >  1:418714/1‑61 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTtgttgt    >  1:83788/1‑61 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:725348/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:732582/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:739096/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:69283/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:681787/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:663880/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:673753/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:786393/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:651733/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:644451/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:637566/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:632045/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:625686/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:61758/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:608364/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:5996/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:589048/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:576589/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:878468/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:992304/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:986691/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:980031/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:974545/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:96902/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:962292/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:95581/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:950150/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:925833/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:908204/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:897874/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:748127/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:868714/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:849959/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:841656/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:831640/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:824036/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:810795/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:791045/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:553682/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:778030/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:758849/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:185876/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:561927/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:284126/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:27246/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:261185/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:251718/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:245981/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:237436/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:231609/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:219804/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:201988/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:189747/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:296995/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:177651/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:167064/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:162082/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:151788/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:132953/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:125360/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:118194/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:108003/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:1031312/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:1019173/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:1009228/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:456141/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:547506/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:537934/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:525896/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:509123/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:497221/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:492123/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:489183/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:480212/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:475068/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:466165/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:306108/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:441318/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:433572/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:426546/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:400849/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:378392/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:365775/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:356446/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:351135/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:333094/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:317405/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACAAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:409447/1‑62 (MQ=255)
gTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTTGtgc  >  1:939339/1‑62 (MQ=255)

GGTGACGCCACCGGTGGTATTGGCGGCAACCAGCAACAGATCAGAGACGCCAATTTGTTGTGC > W3110S.gb/3861534‑3861596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`