Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,861,573 A→G D482D (GAT→GAC)  lldP ← L‑lactate permease

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,861,5730AG100.0% 1578.9 / NA 676D482D (GAT→GAC) lldPL‑lactate permease
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (676/0);  total (676/0)

Only 100 of 676 total aligned reads displayed.

GGTGACGCCACCGGTGGTATTGGCGGCAACCAGCAACAGATCAGAGACGCCAATTTGTTGTGC  >  W3110S.gb/3861534‑3861596
                                       |                       
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCACCCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:100167/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCATCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:388654/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTGAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:840009/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCaga                    >  1:560006/1‑45 (MQ=25)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCaga                    >  1:184319/1‑45 (MQ=25)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGCAACGcc              >  1:915695/1‑51 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATttgt       >  1:463493/1‑58 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTtgttgt    >  1:588982/1‑61 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTtgttgt    >  1:218694/1‑61 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:685836/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:758085/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:698739/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:71261/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:723831/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:732582/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:739096/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:744034/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:790481/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:679830/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:671507/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:662096/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:648437/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:643720/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:635531/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:631998/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:622218/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:617197/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:606433/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:597915/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:888167/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:992304/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:986611/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:979974/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:973387/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:96902/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:962292/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:955720/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:947853/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:925833/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:908204/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:897874/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:777737/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:877082/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:865550/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:855652/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:849282/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:837521/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:830407/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:823942/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:807617/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:798158/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:553290/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:785748/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:177307/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:296995/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:287396/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:281562/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:272370/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:259789/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:250410/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:245865/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:234492/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:229127/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:196003/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:188195/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:306108/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:165991/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:161489/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:151788/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:132953/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:124588/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:118172/1‑62 (MQ=255)
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ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:1031312/1‑62 (MQ=255)
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ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:1009228/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:438530/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:546253/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:53309/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:521963/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:504244/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:496749/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:491297/1‑62 (MQ=255)
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ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:477752/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:472512/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:455071/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:576012/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:43331/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:423292/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:417866/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:40894/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:400849/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:375479/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:365149/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:356446/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:351135/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:333094/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:317405/1‑62 (MQ=255)
 gTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTTGtgc  >  1:939339/1‑62 (MQ=255)
                                       |                       
GGTGACGCCACCGGTGGTATTGGCGGCAACCAGCAACAGATCAGAGACGCCAATTTGTTGTGC  >  W3110S.gb/3861534‑3861596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑