Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,861,579 G→A V480V (GTC→GTT)  lldP ← L‑lactate permease

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,861,5790GA100.0% 1580.1 / NA 671V480V (GTC→GTT) lldPL‑lactate permease
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (671/0);  total (671/0)

Only 100 of 671 total aligned reads displayed.

GGTGACGCCACCGGTGGTATTGGCGGCAACCAGCAACAGATCAGAGACGCCAATTTGTTGTGC  >  W3110S.gb/3861534‑3861596
                                             |                 
ggTGACACCCCCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:798559/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCACCCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:100167/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAAttt         >  1:183064/1‑56 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATttgttg     >  1:662316/1‑60 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTtgttgt    >  1:72407/1‑61 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTtgttgt    >  1:218694/1‑61 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:778030/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:791045/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:758849/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:748127/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:739096/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:732582/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:715290/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:698739/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:692703/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:680831/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:671602/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:650472/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:636965/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:632045/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:625686/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:617462/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:608364/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:5996/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:589048/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:576589/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:563638/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:553290/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:878468/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:979974/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:974545/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:96902/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:962292/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:95581/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:950150/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:925833/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:9164/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:908277/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:897874/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:891241/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:786393/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:867390/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:855652/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:849959/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:840113/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:837802/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:831640/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:824036/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:810795/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:992304/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:986611/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:189747/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:304957/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:296995/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:287396/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:281562/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:272370/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:259789/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:250410/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:245865/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:236298/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:229127/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:196003/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:317405/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:176993/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:165991/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:161489/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:148688/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:131941/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:124588/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:118172/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:107970/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:1031312/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:1019173/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:1009228/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:437941/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:53309/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:51573/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:503489/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:495337/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:490467/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:482626/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:476402/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:472015/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:460963/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:451103/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:546253/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:431469/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:421983/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:41687/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:40894/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:400257/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:38486/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:375479/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:365149/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:355042/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:347938/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTtgtg   >  1:333094/1‑62 (MQ=255)
ggTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACCCGAATTtgttgt    >  1:644049/1‑61 (MQ=255)
 gTGACACCACCGGTGGTGTTGGCAGCAACCAGCAACAGGTCAGAAACGCCAATTTGTTGtgc  >  1:939339/1‑62 (MQ=255)
                                             |                 
GGTGACGCCACCGGTGGTATTGGCGGCAACCAGCAACAGATCAGAGACGCCAATTTGTTGTGC  >  W3110S.gb/3861534‑3861596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑