Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,944,926 C→T pseudogene (471/729 nt) yhjQ → ECK3519:JW5941:b3534; cell division protein; chromosome partitioning ATPase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,944,9260CT100.0% 1412.4 / NA 610pseudogene (471/729 nt)yhjQECK3519:JW5941:b3534; cell division protein; chromosome partitioning ATPase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/610);  total (0/610)

Only 100 of 610 total aligned reads displayed.

AGCGCTGCCGGATGGCGCACATATTTTGATTAATGACTTCCGTATTGGCAGTCAGGTTCAGGA  >  W3110S.gb/3944911‑3944973
               |                                               
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   gcTGCCGTATGGTGCACATATTTTGATTAATGACTTCCGTATTGGCAGCCAGGTTCAGGa  <  1:157470/60‑1 (MQ=255)
           aTGGTGCACATATTTTGATTAATGACTTCCGTATTGGCAGCCAGGTTCAGGa  <  1:272448/52‑1 (MQ=39)
            tGGTGCACATATTTTGATTAATGACTTCCGTATTGGCAGCCAGGTTCAGGa  <  1:380225/51‑1 (MQ=255)
               |                                               
AGCGCTGCCGGATGGCGCACATATTTTGATTAATGACTTCCGTATTGGCAGTCAGGTTCAGGA  >  W3110S.gb/3944911‑3944973

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑